營業稅本身為消費稅，因此並不是所有的單據或發票都可以拿來扣抵營業稅，要扣抵進項稅額有幾個要件：

1. 對方公司行號開立的合法憑證；

2. 有營業稅稅額；

3. 有登打公司或行號的統一編號。

可見單據本身一定是「發票」，凡收據、勞務報酬等，本身沒有營業稅，自然不能扣抵；同時一定發生在國內，海外消費、國外機票、國外公司開的商業發票，因無繳交台灣政府營業稅， 自然無法扣抵。同時由於營業稅本質是消費稅，因此屬於消費稅性質的也不能扣抵。

但即使無法扣抵進項稅額，由於這些支出本身就是屬於公司的費用，因此也必須入帳，這樣在年底時才能得知真正損益。

以下列出營業稅可扣抵項目及不可扣抵的項目：

一、營業稅可扣抵項目

1. 進貨：與公司主要營業內容有關之統一發票。

2. 租金支出：若憑證為統一發票且以公司名義簽定租約，則進項稅額可扣抵。

3. 文具用品

4. 雜項購置：辦公室電器、電腦、冷氣機、電話等

5. 雜費：辦公室清潔用品、零件等。

6. 購買不動產、廠房及設備之統一發票。

7. 員工制服、工作鞋等於營業場所提供員工使用之物品。

8. 旅費支出：國內機票、高(台)鐵車票、客運車票；住宿費，需取得有打統編的發票，連同差旅費一併提供；若是員工旅遊的住宿費，屬員工福利則無法扣抵進項稅額。

9. 運費支出：須取得宅配、快遞及貨運公司之進項發票。

10. 郵電費：公司使用之電話、電報、網路費等之進項發票。

11. 修繕費用：公司車輛、辦公設備、建物等之維修，需取得進項發票始得扣抵。

12. 廣告費：與公司業務相關之報章雜誌廣告、傳單、海報、樣品、電視、網路廣告等，只要取得進項發票即可扣抵進項稅額。

13. 水電瓦斯費：有公司抬頭及統編之水電費及瓦斯費。

14. 研發費：為研究新產品、改善生產技術等支付之費用。

15. 訓練費用：為培育員工、辦理或指派參加與公司業務相關之訓練費用。

16. 燃料費：車輛加油及燃料油之費用。

17. 勞務費：須取得有打統編的進項發票，如顧問公司費用、翻譯費用。

18. 雜項購置：辦公室電器、電腦、冷氣機、電話等

19. 雜費：辦公室清潔用品、零件等。

20. 購買不動產、廠房及設備之統一發票。

17. 員工制服、工作鞋等於營業場所提供員工使用之物品。

二、不可扣抵項目

1. 薪資支出：支付員工的各項酬勞，如薪資、獎金、津貼、加班費等。不可扣抵進項稅額。

2. 個人之餐飲支出。

3. 一般衣飾、皮包等。

4. 招待客戶之交際費，包含所支付之旅費、住宿費。

5. 交際應酬贈與他人之禮物、或股東會贈送股東之紀念品。

6. 自用小客車

(1) 員工福利相關支出。

(2) 捐贈之物品

(3) 租車接送員工上下班，租金之進項稅不得扣抵銷項稅額。